257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2122 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
181 aa  351  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  56.47 
 
 
195 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  51.74 
 
 
181 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  59.01 
 
 
182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  55.09 
 
 
175 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  54.71 
 
 
179 aa  154  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  48.26 
 
 
181 aa  150  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  50.56 
 
 
184 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  50.62 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  51.11 
 
 
182 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  49.1 
 
 
188 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  54.07 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  50.6 
 
 
182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  48.31 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  45.81 
 
 
194 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  43.4 
 
 
193 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  45.83 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  44.63 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  45.7 
 
 
193 aa  118  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  46.33 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.65 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  46.78 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  47.53 
 
 
193 aa  110  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  41.94 
 
 
200 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  40.13 
 
 
194 aa  94.4  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  34.21 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  36.42 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.41 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  36.67 
 
 
449 aa  85.1  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  38.69 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.37 
 
 
443 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.37 
 
 
443 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.37 
 
 
443 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  33.77 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.41 
 
 
203 aa  80.9  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  41.4 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  29.09 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  38.51 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.63 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.05 
 
 
445 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  30.73 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  28.31 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.93 
 
 
446 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.65 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  26.7 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.76 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  32.19 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.78 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  29.61 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  21.79 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  31.87 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.3 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  34.01 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  29.17 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  26.57 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  30.94 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  29.63 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.03 
 
 
162 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  33.85 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  27.65 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  32.31 
 
 
157 aa  62.4  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 
156 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>