More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1799 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
173 aa  320  4e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  31.54 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  38.51 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  36.17 
 
 
164 aa  94.4  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  44.14 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  31.01 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
178 aa  88.6  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  28.49 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
206 aa  88.2  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  34.25 
 
 
165 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  41.67 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  33.94 
 
 
179 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  42.07 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  31.87 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  34.94 
 
 
172 aa  85.1  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  37.11 
 
 
194 aa  84.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  32.92 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  37.74 
 
 
181 aa  84.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  38.89 
 
 
189 aa  84.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  38.06 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  37.89 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  32.73 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  33.13 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  32.73 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  35.57 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.13 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  27.38 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  37.42 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  37.74 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.75 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  37.32 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  27.92 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.83 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  31.91 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  36.03 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.7 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  32.64 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  29.56 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  30.6 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.75 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  34.31 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  34.31 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  32.32 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  35.42 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  33.96 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  36.94 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  29.3 
 
 
199 aa  72  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.45 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  31.94 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  36.6 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  40.14 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  27.16 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
448 aa  68.6  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  25.93 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  27.52 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  30.34 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  32.65 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  33.81 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.57 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  32.86 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.15 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  36.42 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.86 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  37.78 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  32.86 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.86 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.93 
 
 
443 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.86 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  32.3 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  32.86 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.93 
 
 
443 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.93 
 
 
443 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.33 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  34.9 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  34.29 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>