293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1713 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
171 aa  338  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  82.08 
 
 
173 aa  287  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  82.08 
 
 
173 aa  287  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  44.85 
 
 
168 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  43.29 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  43.9 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  43.29 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  43.29 
 
 
168 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  43.29 
 
 
168 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  43.29 
 
 
168 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  43.29 
 
 
168 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  43.29 
 
 
168 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  43.29 
 
 
168 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  43.29 
 
 
168 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  42.01 
 
 
178 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  39.1 
 
 
167 aa  120  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  42.6 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  38.85 
 
 
162 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  33.92 
 
 
175 aa  100  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  34.73 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  39.74 
 
 
164 aa  98.6  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  32.45 
 
 
176 aa  97.4  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  31.36 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  32.34 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.99 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.29 
 
 
206 aa  95.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.52 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
172 aa  94  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  34.19 
 
 
175 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34.27 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  32.16 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  36.13 
 
 
164 aa  89  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  35.37 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  36.54 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  33.33 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30.18 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  28.22 
 
 
175 aa  84  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  26.99 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  31.9 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  31.9 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  26.99 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  32.67 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  30.41 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  26.99 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.24 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.13 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  31.51 
 
 
238 aa  79  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  31.47 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.14 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  30.97 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  36.84 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  28.66 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  33.58 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  29.33 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  31.68 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  25.32 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  28.38 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  21.79 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  31.17 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  25.49 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  35.51 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  25.16 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  30.14 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  23.33 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  30.41 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  26.45 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>