291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1303 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
200 aa  390  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  62.5 
 
 
194 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  61.31 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  56.71 
 
 
193 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  49.74 
 
 
194 aa  175  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  53.09 
 
 
179 aa  166  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  48.75 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  54.12 
 
 
189 aa  160  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  51.74 
 
 
181 aa  158  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  44.58 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  50.27 
 
 
182 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  49.4 
 
 
184 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  48.21 
 
 
182 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  47.09 
 
 
192 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  55.71 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  43.43 
 
 
195 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  51.69 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  50.6 
 
 
181 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  42.6 
 
 
181 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  48.55 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  42.37 
 
 
179 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  42.37 
 
 
182 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  50 
 
 
184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  41.24 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  41.95 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  47.13 
 
 
179 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  41.94 
 
 
181 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  39.55 
 
 
191 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  45.96 
 
 
191 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  29.88 
 
 
206 aa  87  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  34.19 
 
 
448 aa  82.4  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.9 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  32.69 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  26.92 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.21 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  35.19 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.01 
 
 
443 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  31.62 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.01 
 
 
443 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.01 
 
 
443 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  32.87 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
156 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
156 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
156 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.48 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  72  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.25 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.17 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  31.43 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  32.08 
 
 
163 aa  71.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  31.4 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  32.88 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  35.57 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  36.24 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  31.69 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  34.13 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  36.24 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.12 
 
 
446 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.75 
 
 
445 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  35.57 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  35.57 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  32.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  32.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  37.3 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.12 
 
 
445 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  32.39 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  35.57 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  35.57 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>