248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5023 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
151 aa  285  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  58.67 
 
 
164 aa  176  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  48.67 
 
 
164 aa  140  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  45.33 
 
 
164 aa  130  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  41.61 
 
 
167 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  46.04 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  43.62 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  42.03 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  38.93 
 
 
164 aa  106  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  39.2 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  36.49 
 
 
175 aa  90.9  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  38.1 
 
 
175 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  39.73 
 
 
175 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  35.92 
 
 
175 aa  84.3  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  34.46 
 
 
175 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  38.1 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  34.69 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  38.28 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  34.29 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  29.17 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  29.17 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.43 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  38.81 
 
 
203 aa  70.5  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
168 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  31.03 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  32.85 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  30.56 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  29.17 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  33.86 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.53 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  31.91 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  33.57 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  32.31 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  33.08 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  33.08 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  32 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  33.59 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
203 aa  60.8  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  27.91 
 
 
156 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  34.92 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.08 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  31.43 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  28.77 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  32.14 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  34.04 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 
175 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  29.1 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  32 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  31.37 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  31.94 
 
 
182 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  31.76 
 
 
179 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  28.68 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  28.97 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>