More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3920 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
182 aa  345  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  66.67 
 
 
181 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  63.53 
 
 
182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  55.56 
 
 
189 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  56.02 
 
 
188 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  52.6 
 
 
182 aa  157  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  52.63 
 
 
184 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  51.69 
 
 
200 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  52.63 
 
 
194 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  53.63 
 
 
192 aa  150  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  48.15 
 
 
181 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  48.78 
 
 
195 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  49.38 
 
 
193 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  54.71 
 
 
181 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  49.08 
 
 
191 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  45.83 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  50 
 
 
193 aa  137  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  52.33 
 
 
184 aa  137  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  47.37 
 
 
175 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  54.88 
 
 
193 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  52.05 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  47.37 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  52.47 
 
 
196 aa  132  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  43.93 
 
 
179 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  56.88 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  46.34 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  51.18 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  42.42 
 
 
179 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 
172 aa  108  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  32.2 
 
 
180 aa  102  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  33.95 
 
 
206 aa  91.3  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  32.92 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  35.84 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  37.59 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  31.71 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.78 
 
 
445 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  31.87 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.68 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.14 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  29.81 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  34.38 
 
 
448 aa  74.7  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  34.64 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  35.29 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  31.1 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  36.05 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  34.21 
 
 
156 aa  72  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  34.44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  34.44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  37.41 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  37.41 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  37.41 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  37.41 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  37.41 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  37.89 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  34.64 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  34.64 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  36.05 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.25 
 
 
443 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.25 
 
 
443 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.25 
 
 
443 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  34.64 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  34.69 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4336  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.14 
 
 
261 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00624373  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>