190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4332 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
166 aa  326  9e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  85.38 
 
 
171 aa  290  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  64.2 
 
 
169 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  64.2 
 
 
169 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  64.2 
 
 
169 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  56.21 
 
 
171 aa  187  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.41 
 
 
166 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.83 
 
 
170 aa  114  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  38.57 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  35.48 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  36.6 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  29.55 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  30.94 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.23 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  33.13 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  33.81 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.5 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  28.39 
 
 
206 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  28.74 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  33.11 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  32.43 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  36.84 
 
 
182 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  30.94 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  28.93 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.41 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  30.22 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  33.1 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  32.86 
 
 
193 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  27.59 
 
 
193 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  23.24 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  23.24 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  27.86 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 
146 aa  58.2  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.86 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.06 
 
 
203 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.2 
 
 
138 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  25.35 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  25.87 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.22 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  32.03 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  33.02 
 
 
448 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  23.29 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.86 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  27.86 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  25.17 
 
 
156 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  30.5 
 
 
168 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  30.5 
 
 
168 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  30.5 
 
 
168 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  30.5 
 
 
168 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
174 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  28.06 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  30.5 
 
 
168 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  30.5 
 
 
168 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  24.65 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
179 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 
177 aa  51.2  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  23.78 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
168 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 
156 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
168 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  24.32 
 
 
178 aa  50.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  32.45 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  24.65 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  24.83 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  26.57 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  25.87 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  28.78 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  28.78 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.09 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.78 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  30.99 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  25.87 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  28.99 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.78 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  23.94 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.71 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  28.17 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0299  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199967  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  23.4 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  28.78 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0304  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  28.17 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.78 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  28.06 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  28.17 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  28.06 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  24.83 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  34.69 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>