204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2314 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
171 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  85.38 
 
 
166 aa  290  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  61.68 
 
 
169 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  61.68 
 
 
169 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  61.68 
 
 
169 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  57.58 
 
 
171 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.03 
 
 
166 aa  121  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.55 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  37.23 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.28 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  34.19 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  32.37 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  35.1 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.11 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  36.42 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.76 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  34.04 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.13 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  31.74 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  34.52 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  30.28 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
193 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 
194 aa  61.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 
193 aa  60.8  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  32.16 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  31.79 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  32.48 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  32.12 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  31.29 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.5 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.87 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  32.67 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  29.13 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.69 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  24.64 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  24.64 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  57.4  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  32.39 
 
 
193 aa  57.4  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  27.34 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.2 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  33.57 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  29.5 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.1 
 
 
138 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  32.63 
 
 
448 aa  54.7  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  30.99 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.29 
 
 
194 aa  54.3  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  25.87 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  26.81 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  29.71 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  30.28 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  26.57 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.36 
 
 
443 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.36 
 
 
443 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.36 
 
 
443 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.86 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  28.99 
 
 
156 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 
156 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  25.68 
 
 
165 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.76 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  25.87 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  27.66 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  27.66 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 
156 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  24.29 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  27.07 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.85 
 
 
208 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  29.73 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0304  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801796 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.85 
 
 
208 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>