258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6140 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
182 aa  357  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  60 
 
 
195 aa  190  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  56.9 
 
 
182 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  50.89 
 
 
181 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  54.07 
 
 
181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  49.71 
 
 
194 aa  160  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  49.42 
 
 
181 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  52.3 
 
 
175 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  47.93 
 
 
189 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  47.78 
 
 
200 aa  153  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  54.71 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  50.29 
 
 
182 aa  151  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  48.35 
 
 
182 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  49.46 
 
 
184 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  50.28 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  46.95 
 
 
193 aa  140  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  48.19 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  47.83 
 
 
179 aa  137  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  46.88 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  52.05 
 
 
182 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  48.26 
 
 
191 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  44.31 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  37.13 
 
 
172 aa  129  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  47.22 
 
 
196 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  45.4 
 
 
184 aa  121  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  41.62 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  34.18 
 
 
180 aa  115  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.49 
 
 
206 aa  94.4  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  38.16 
 
 
181 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  43.53 
 
 
191 aa  89  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  36.02 
 
 
448 aa  88.2  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.32 
 
 
443 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.32 
 
 
443 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.32 
 
 
443 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.92 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  35.98 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
446 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  29.59 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  33.97 
 
 
449 aa  75.5  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.38 
 
 
445 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.32 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.01 
 
 
445 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  26.95 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.75 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  33.74 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  30.61 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  25.45 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  34.39 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  34.39 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  34.39 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  32.61 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.59 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  34.64 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  30.25 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  28.49 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 
161 aa  62.8  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  32.19 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  28.49 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  32.61 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  30.59 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.84 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  28.49 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  31.88 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  28.49 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
203 aa  58.5  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1700  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  30.46 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>