261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0896 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  100 
 
 
181 aa  336  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  76.92 
 
 
182 aa  227  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  66.67 
 
 
182 aa  184  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  52.38 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  55.28 
 
 
189 aa  171  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  54.22 
 
 
182 aa  165  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  56.25 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  49.72 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  54.27 
 
 
192 aa  158  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  54.17 
 
 
182 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  51.52 
 
 
194 aa  158  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  51.74 
 
 
200 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  50.6 
 
 
191 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  50.3 
 
 
184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  48.26 
 
 
181 aa  150  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  50.89 
 
 
175 aa  141  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  49.42 
 
 
179 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  43.9 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  50.3 
 
 
193 aa  137  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  51.2 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  50.6 
 
 
182 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  54.04 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  50 
 
 
193 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.44 
 
 
179 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  44.51 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  50.3 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  55.95 
 
 
179 aa  124  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  33.93 
 
 
172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  38.36 
 
 
180 aa  107  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  33.54 
 
 
206 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  47.59 
 
 
191 aa  99  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  35.19 
 
 
203 aa  94  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  30.99 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  32.93 
 
 
203 aa  85.1  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.81 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.19 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  34.32 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  32.3 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.21 
 
 
445 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  28.75 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  27.16 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.55 
 
 
445 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  32.18 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28.22 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  35.29 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  34.59 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  32.02 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  30.57 
 
 
448 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  26.54 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
446 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  35.37 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.54 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  35.37 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  24.85 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  26.75 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.38 
 
 
443 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.38 
 
 
443 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  34.52 
 
 
171 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.38 
 
 
443 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  32.43 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.32 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.14 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
178 aa  61.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  31.74 
 
 
173 aa  61.2  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  32.37 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  31.46 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30.9 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  32.89 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  31.47 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  30.94 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  37.4 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  31.52 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.58 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  27.07 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  32.45 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  24 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  24.83 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>