255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1127 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
172 aa  338  2e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  59.51 
 
 
180 aa  201  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  52.44 
 
 
194 aa  179  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  48.75 
 
 
200 aa  164  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  48.47 
 
 
193 aa  159  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  51.83 
 
 
193 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  46.3 
 
 
194 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  41.98 
 
 
179 aa  134  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  40.37 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  41.61 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  40 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  35.93 
 
 
195 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  33.93 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  40.94 
 
 
182 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  41.1 
 
 
192 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  41.48 
 
 
188 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  36.97 
 
 
182 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  40 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  34.15 
 
 
181 aa  97.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  34.21 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  35.62 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
182 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  36.31 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.38 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  32.92 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  36.3 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.57 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  29.94 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.25 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  32.37 
 
 
161 aa  72  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.67 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.03 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  26.06 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  36.51 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.83 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  32.89 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  25.48 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  34.09 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.41 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  25.31 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.53 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  28.74 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  25.16 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  30.59 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.04 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  29.05 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.05 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  29.05 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  28.22 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  32.58 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  32.58 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  32.31 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  34.94 
 
 
173 aa  61.2  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3970  F0F1 ATP synthase subunit B  33.81 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00376909  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  30.06 
 
 
175 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  27.44 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.38 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  32.81 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>