234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1020 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
193 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  61.26 
 
 
196 aa  215  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  45.71 
 
 
195 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  48.33 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  45.25 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  44.44 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  43.02 
 
 
179 aa  124  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  41.9 
 
 
181 aa  124  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  48.59 
 
 
182 aa  124  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  43.82 
 
 
184 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  39.38 
 
 
200 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  40.96 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  45.6 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  43.58 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  42.46 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  42.11 
 
 
194 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  42.86 
 
 
175 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  43.58 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.2 
 
 
192 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  43.89 
 
 
182 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  37.2 
 
 
193 aa  102  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  42.05 
 
 
193 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
172 aa  97.8  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  40.25 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.57 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  28.74 
 
 
180 aa  92  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  32.18 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  34.91 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  37.71 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.5 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  43.53 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  28.48 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.82 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  26.74 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  27.85 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.25 
 
 
264 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  29.75 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
166 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.03 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  27.37 
 
 
203 aa  61.6  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  27.22 
 
 
167 aa  61.2  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  30.5 
 
 
156 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  29.81 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  32.12 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  32.12 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  32.12 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  32.12 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 
146 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.81 
 
 
162 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  33.79 
 
 
173 aa  58.2  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  29.63 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.39 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  31.06 
 
 
448 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  27.22 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  25.66 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  30.5 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.9 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
156 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  27.94 
 
 
156 aa  55.1  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  24.24 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  28.77 
 
 
156 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  25.55 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>