246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1667 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
182 aa  348  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  76.92 
 
 
181 aa  264  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  57.23 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  63.53 
 
 
182 aa  181  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  56.14 
 
 
182 aa  174  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  56.91 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  54.91 
 
 
184 aa  168  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  54.34 
 
 
182 aa  167  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  49.12 
 
 
195 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  50.27 
 
 
200 aa  160  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  46.41 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  50.6 
 
 
181 aa  159  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  54.07 
 
 
192 aa  159  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  50.9 
 
 
194 aa  158  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  52.78 
 
 
184 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  51.81 
 
 
191 aa  148  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  47.59 
 
 
193 aa  147  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  52.1 
 
 
193 aa  141  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  50.89 
 
 
182 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  46.82 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  57.89 
 
 
179 aa  137  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  45.2 
 
 
179 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  53.33 
 
 
181 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  45.56 
 
 
194 aa  134  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  48.47 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  46.93 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  42.35 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
172 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.54 
 
 
206 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  47.56 
 
 
191 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  32.95 
 
 
203 aa  94.4  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  31.64 
 
 
175 aa  89  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  31.68 
 
 
175 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  28.41 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  38.65 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.67 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  29.41 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  37.8 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  37.8 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  37.8 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  39.74 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  35.58 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  28.41 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  30.86 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.31 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.89 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  37.33 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  31.01 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  35.12 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  26.39 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  35.53 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  36.67 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.22 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.55 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.74 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.28 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 
161 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  31.72 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  31.72 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.38 
 
 
443 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.38 
 
 
443 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.38 
 
 
443 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.29 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 
164 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
446 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  29.92 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.87 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  32.21 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  32.81 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  31.39 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  32.21 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  27.54 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  24.68 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  25.48 
 
 
161 aa  58.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.21 
 
 
185 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.21 
 
 
185 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  34.59 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  25.93 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  28.9 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  29.55 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  32.54 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>