More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3865 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 443 aa  863    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 443 aa  863    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 443 aa  863    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.3 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.2 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.72 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  46.09 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  44.2 
 
 		 449 aa  342  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 271 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  40.97 
 
 		 290 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  42.32 
 
 		 275 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  39.38 
 
 		 274 aa  160  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.13 
 
 		 274 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  38.02 
 
 		 273 aa  153  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  39.33 
 
 		 276 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  37.93 
 
 		 275 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  36.47 
 
 		 269 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 		 269 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  36.5 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  33.95 
 
 		 275 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  35.63 
 
 		 274 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  34.07 
 
 		 274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  35.25 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  34.44 
 
 		 271 aa  126  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  33.7 
 
 		 271 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.86 
 
 		 276 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  35.17 
 
 		 271 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  31.48 
 
 		 271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  33.58 
 
 		 274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.35 
 
 		 279 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  34.19 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  29.84 
 
 		 275 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  34.81 
 
 		 270 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  31.48 
 
 		 271 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  37.06 
 
 		 182 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  35.93 
 
 		 195 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  28.63 
 
 		 275 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  35.37 
 
 		 181 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  34.46 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  31.08 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  33.77 
 
 		 181 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  30.41 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  32.08 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.5 
 
 		 278 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.96 
 
 		 182 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  29.01 
 
 		 200 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  28.3 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  30.23 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 		 156 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  26.14 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  29.61 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  30.61 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.19 
 
 		 179 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.88 
 
 		 192 aa  65.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  25.66 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  30.3 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.9 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  30.26 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  28.39 
 
 		 193 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.47 
 
 		 182 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  28.38 
 
 		 181 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 156 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 		 156 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  26.8 
 
 		 199 aa  62  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 190 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 		 156 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  23.53 
 
 		 156 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  24.18 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  23.9 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  28.03 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.33 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  27.41 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  25.17 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  24.18 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 		 156 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 156 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1700  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 		 156 aa  59.7  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.59 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 156 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 156 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  24.18 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  24 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  23.94 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>