256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1668 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  100 
 
 
270 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  68.4 
 
 
269 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  58.43 
 
 
275 aa  278  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.19 
 
 
269 aa  248  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  49.27 
 
 
274 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.49 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  44.24 
 
 
276 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.96 
 
 
274 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  42.44 
 
 
273 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  44.8 
 
 
275 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  44.58 
 
 
274 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  44.98 
 
 
290 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  38.15 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  41.53 
 
 
275 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  38.97 
 
 
271 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  40.23 
 
 
274 aa  158  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  40.22 
 
 
271 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  44.18 
 
 
274 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  38.78 
 
 
275 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.68 
 
 
276 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.55 
 
 
445 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  38.75 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  38.93 
 
 
271 aa  145  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  36.43 
 
 
271 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.5 
 
 
443 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.5 
 
 
443 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  37.2 
 
 
275 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.5 
 
 
443 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  35.43 
 
 
275 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.4 
 
 
445 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  35.93 
 
 
448 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.8 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.88 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  32.32 
 
 
449 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  39.48 
 
 
270 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.23 
 
 
278 aa  102  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  33.82 
 
 
271 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.68 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.87 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.38 
 
 
182 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.42 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.32 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.87 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.76 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.03 
 
 
182 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.35 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  29.34 
 
 
178 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.74 
 
 
186 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
186 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.95 
 
 
182 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.3 
 
 
180 aa  63.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  27.44 
 
 
193 aa  62.8  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.1 
 
 
182 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  41.67 
 
 
157 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.1 
 
 
182 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  26.11 
 
 
182 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.79 
 
 
180 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
186 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
180 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  29.13 
 
 
192 aa  59.3  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.1 
 
 
186 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
186 aa  59.3  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.49 
 
 
178 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  24.37 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  29.75 
 
 
197 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.54 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.54 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.54 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.54 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.54 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
186 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
186 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.36 
 
 
182 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  28.22 
 
 
201 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  23.53 
 
 
188 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  28.1 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
177 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
190 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  30.46 
 
 
179 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.45 
 
 
182 aa  57  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.5 
 
 
180 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  24.39 
 
 
173 aa  56.6  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 
180 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  25.62 
 
 
176 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.13 
 
 
182 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 
180 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  40.3 
 
 
118 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.75 
 
 
179 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 
180 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 
180 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.88 
 
 
178 aa  55.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 
180 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.17 
 
 
180 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.88 
 
 
193 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.81 
 
 
186 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>