More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1641 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
179 aa  344  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.65 
 
 
190 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
186 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
182 aa  98.6  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.68 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.93 
 
 
182 aa  94.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  32.34 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  31.61 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  29.21 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  33.73 
 
 
179 aa  85.5  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 
184 aa  84.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.16 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  33.54 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  30.54 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  32.2 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  28.9 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  28.9 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  25.14 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  28.32 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
196 aa  77.4  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  31.36 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30.95 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.38 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  25.15 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  28.4 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  23.86 
 
 
227 aa  74.3  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.71 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.1 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  28.75 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.44 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.34 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.51 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0005  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000453389  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0518  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.54 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  28.24 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  24.39 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.61 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03619  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00523657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5171  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00189703  decreased coverage  0.00512499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4251  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538372  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  23.35 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4103  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00374645  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3951  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000356722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  26.9 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  32 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>