More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2385 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  100 
 
 
182 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.81 
 
 
182 aa  144  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.71 
 
 
182 aa  137  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.11 
 
 
178 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.26 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.07 
 
 
181 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  36.31 
 
 
178 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  35.03 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  35.37 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  35.47 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
180 aa  110  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  29.89 
 
 
176 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
180 aa  101  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
183 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
181 aa  101  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
180 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
180 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.84 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  30.11 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
180 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  34.46 
 
 
188 aa  98.6  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  30.11 
 
 
201 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.88 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
179 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  27.68 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.87 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.87 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.74 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.74 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
178 aa  87.8  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  27.84 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
186 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.14 
 
 
182 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.6 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.84 
 
 
179 aa  85.5  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.83 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 
193 aa  85.1  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.15 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.29 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.02 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.83 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  26.11 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.06 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.02 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  32.57 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.83 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  27.12 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.33 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  29.05 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.65 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  27.62 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17830  ATP synthase F1, delta subunit  31.32 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.17 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  29.05 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
271 aa  77.8  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.68 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  27.27 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.68 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  25.9 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>