244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1760 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 275 aa  526  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  44.72 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  41.87 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  41.06 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  43.57 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  41.3 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  38.6 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.11 
 
 		 269 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  40.24 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  40.3 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.19 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.75 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  39.68 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  38.68 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  40.74 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  34.66 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  36.65 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  38.31 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.25 
 
 		 443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  35.86 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.25 
 
 		 443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.25 
 
 		 443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  39.36 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  36.23 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.03 
 
 		 445 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  38.01 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.33 
 
 		 445 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  35.06 
 
 		 448 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  40.95 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.2 
 
 		 446 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.17 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.7 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  30.22 
 
 		 449 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 		 278 aa  99  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  31.39 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  36.16 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  32.7 
 
 		 193 aa  85.9  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  34.56 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.94 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.94 
 
 		 179 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.08 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.88 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.72 
 
 		 180 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.66 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  29.08 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.66 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.49 
 
 		 182 aa  62  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  27.67 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.73 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.6 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.97 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  36.14 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.54 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  35.8 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.14 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.11 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.14 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.37 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.51 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.16 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.35 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.47 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.36 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  36.49 
 
 		 180 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.49 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.22 
 
 		 178 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  27.52 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  32.58 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 		 183 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  32.58 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  27.95 
 
 		 176 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  36 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.35 
 
 		 186 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.52 
 
 		 192 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  38.16 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.54 
 
 		 178 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.97 
 
 		 184 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  38.03 
 
 		 118 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 		 180 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.49 
 
 		 190 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 		 180 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 		 180 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1621  ATP synthase F1, delta subunit  24 
 
 		 182 aa  52  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0670992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  40.68 
 
 		 177 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  24.83 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  29.1 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  25.6 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  21.79 
 
 		 173 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.71 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  27.41 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.93 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.83 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>