More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0314 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  42.77 
 
 		 179 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.12 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.59 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.68 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.01 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.82 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.53 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  35.03 
 
 		 182 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.64 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.99 
 
 		 180 aa  118  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.45 
 
 		 179 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.53 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  38.95 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.6 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  40.46 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.51 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.71 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.71 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.36 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  34.3 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.39 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.39 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.78 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.56 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.51 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.71 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.2 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.88 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  32 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  32.57 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.5 
 
 		 179 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 		 190 aa  94.4  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 186 aa  94.7  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  31.84 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.43 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  35 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  31.21 
 
 		 180 aa  92  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  35.84 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.38 
 
 		 183 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  31.28 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 		 180 aa  91.3  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  35.59 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  35.59 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  31.61 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  32.09 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.44 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  29.94 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  34.27 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  33.15 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.87 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  33.71 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  34.68 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  34.92 
 
 		 217 aa  88.2  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 		 178 aa  88.2  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 		 180 aa  88.2  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.45 
 
 		 179 aa  88.2  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.67 
 
 		 178 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.67 
 
 		 178 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  31.03 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.39 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.39 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1977  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.27166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.84 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.24 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  29.48 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.74 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>