More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2937 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  100 
 
 		 186 aa  362  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  63.44 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  60.75 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  60.75 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  59.14 
 
 		 217 aa  210  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  61.29 
 
 		 186 aa  197  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  52.69 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.24 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.24 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.77 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.51 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.07 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.28 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.51 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.19 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.51 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.13 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.4 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.82 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.86 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  41.48 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  43.17 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.82 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  42.08 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  42.78 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.7 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.72 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.71 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  42.86 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  38.64 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  40.11 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  37.5 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  37.5 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  38.22 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  39.31 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  32.96 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  32.46 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  33.52 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 		 179 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  30.46 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  28 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.31 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  30.86 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.12 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  31.55 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03280  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  30.95 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.16 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  27.17 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.05 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.05 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  29.21 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  28.89 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3733  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  32.76 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  31.21 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  27.07 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.58 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  28 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>