239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03280 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND03280  conserved hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  409  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  44.78 
 
 
227 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  36.23 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  32.86 
 
 
218 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  34.07 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.32 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.22 
 
 
186 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.22 
 
 
186 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  28.02 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  32.39 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  32.34 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  29.67 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.02 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.02 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  28.57 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.28 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  29.93 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  26.4 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  32.58 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.22 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  31.76 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  26.14 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  29.2 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  31.72 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  29.07 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  24.04 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.28 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  29.61 
 
 
198 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
177 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
178 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
176 aa  62  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.26 
 
 
175 aa  61.6  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  26.37 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.26 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  27.14 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  27.88 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.33 
 
 
175 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  28 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0427  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0288097  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  24.86 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.17 
 
 
186 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 
177 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.17 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  28.02 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  30.15 
 
 
178 aa  58.9  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.37 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  22.81 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.99 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0656  ATP synthase F1, delta subunit  27.43 
 
 
186 aa  58.5  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0940126  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
179 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  29.29 
 
 
178 aa  58.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1699  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.82 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.315472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  23.53 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.03 
 
 
177 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  34 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  34 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
179 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  34 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  34 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  34 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  24.29 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0488  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.08 
 
 
175 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.168229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.05 
 
 
445 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.37 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  21.67 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.17 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>