More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3739 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
182 aa  359  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.22 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
181 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
180 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
180 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
180 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
180 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
180 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
180 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 
179 aa  104  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
180 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
178 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
182 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.66 
 
 
180 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
182 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
182 aa  92  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 
178 aa  89  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  30.54 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  32.18 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  28.31 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 
175 aa  85.1  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
193 aa  84.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  29.94 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  32.57 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
217 aa  82  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  27.27 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  24 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  29.07 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.43 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.03 
 
 
271 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.96 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  28.31 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  28.4 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  24.71 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.96 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  27.88 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  31.18 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.25 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  25.57 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  28.99 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  32.35 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.27 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  29.17 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  32.69 
 
 
157 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>