More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0988 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  100 
 
 
157 aa  305  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  52.63 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  42.21 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  55.07 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  32.69 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.94 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.74 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.79 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  33.98 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4750  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.74 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.79 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4368  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.85 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  40.38 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4313  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.85 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.324517  hitchhiker  0.0000000000831878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4369  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.85 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3928  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.79 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0640299  hitchhiker  0.00610121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4510  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.85 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  35.58 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  40.74 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  40.74 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.91 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  40.74 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.78 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  34.9 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.74 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
182 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.45 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.91 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.45 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.52 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.91 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.38 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  39.05 
 
 
271 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  29.48 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  43.28 
 
 
270 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  35.51 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  41.77 
 
 
274 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.23 
 
 
179 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.79 
 
 
271 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.06 
 
 
177 aa  60.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.25 
 
 
175 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.91 
 
 
179 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.91 
 
 
179 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.48 
 
 
180 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
181 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3959  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.58 
 
 
177 aa  60.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.307164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  31.65 
 
 
176 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
180 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.21 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.84 
 
 
269 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.91 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  30.36 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  31.13 
 
 
197 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  30.39 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  30.23 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.47 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.47 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.96 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.96 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  43.28 
 
 
275 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.67 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.96 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  35.71 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.02 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  34 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.13 
 
 
183 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  28.98 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  46.27 
 
 
271 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.27 
 
 
445 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.25 
 
 
183 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
180 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.47 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.7 
 
 
185 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.89 
 
 
180 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.7 
 
 
185 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.47 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.65 
 
 
178 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.65 
 
 
178 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.65 
 
 
180 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0427  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.89 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0288097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.65 
 
 
183 aa  57.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 
186 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
177 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  33.72 
 
 
217 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  29.25 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.02 
 
 
184 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0488  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.44 
 
 
175 aa  57.4  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.168229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>