249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1215 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
271 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  47.19 
 
 
275 aa  231  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  43.91 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  46.49 
 
 
270 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.07 
 
 
269 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.8 
 
 
274 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  47.97 
 
 
271 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  43.68 
 
 
274 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  42.07 
 
 
273 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  43.49 
 
 
276 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  42.38 
 
 
274 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  43.44 
 
 
275 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  44.12 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  38.38 
 
 
271 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  41.64 
 
 
290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  44.28 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  41.48 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
443 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
443 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  40.81 
 
 
448 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
443 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  35.19 
 
 
449 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  37.28 
 
 
275 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
445 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  41.91 
 
 
274 aa  161  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  38.29 
 
 
275 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.85 
 
 
279 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.51 
 
 
276 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.82 
 
 
446 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.55 
 
 
445 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  36.8 
 
 
275 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  38.75 
 
 
275 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  36.53 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  34.41 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  40.15 
 
 
270 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.46 
 
 
278 aa  99  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  34.8 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.07 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.22 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  27.03 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.14 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  30.72 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.28 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  26.51 
 
 
182 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.96 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.5 
 
 
180 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.07 
 
 
179 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.3 
 
 
186 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  23.24 
 
 
188 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.78 
 
 
179 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.69 
 
 
186 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  41.79 
 
 
157 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  28.24 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.31 
 
 
182 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.85 
 
 
179 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.29 
 
 
182 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  28.09 
 
 
176 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
182 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  26.67 
 
 
182 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  34.43 
 
 
158 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  31.54 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.46 
 
 
186 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.21 
 
 
188 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  38.67 
 
 
179 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  24 
 
 
180 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.46 
 
 
178 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.46 
 
 
178 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  43.28 
 
 
118 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 
181 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  29.79 
 
 
178 aa  55.8  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
178 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  22.67 
 
 
183 aa  55.5  0.0000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2330  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.63 
 
 
207 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00362801  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  37.68 
 
 
158 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2027  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.0511628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  37.33 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.67 
 
 
184 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.38 
 
 
190 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  23.4 
 
 
185 aa  55.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  37.33 
 
 
186 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  37.33 
 
 
186 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.78 
 
 
186 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.82 
 
 
186 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.78 
 
 
186 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.55 
 
 
176 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.81 
 
 
181 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  30.85 
 
 
135 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.38 
 
 
186 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.99 
 
 
186 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.94 
 
 
183 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  28.72 
 
 
178 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
180 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  26 
 
 
183 aa  53.1  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.85 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  25.26 
 
 
217 aa  52.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 
187 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>