223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0650 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
274 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.42 
 
 
269 aa  215  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  43.59 
 
 
274 aa  201  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  46.5 
 
 
275 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.8 
 
 
271 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  43.93 
 
 
269 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  44.18 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  43.8 
 
 
270 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  43.17 
 
 
276 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  42.86 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  40.37 
 
 
274 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.75 
 
 
276 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  44.48 
 
 
290 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.5 
 
 
445 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.13 
 
 
443 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.13 
 
 
443 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.13 
 
 
443 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  41.76 
 
 
271 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.96 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  42.19 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  33.81 
 
 
275 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  36.1 
 
 
448 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  35.77 
 
 
271 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  39.86 
 
 
274 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.13 
 
 
445 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.33 
 
 
446 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  34.07 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  36.8 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  34.4 
 
 
275 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  37.73 
 
 
271 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
449 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  31.54 
 
 
275 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  38.99 
 
 
274 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  31.62 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  36.07 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.78 
 
 
278 aa  106  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  36.23 
 
 
270 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.79 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  30.94 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.49 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.12 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.32 
 
 
182 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.12 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.3 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.92 
 
 
186 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.24 
 
 
184 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.71 
 
 
180 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.38 
 
 
179 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.44 
 
 
182 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.71 
 
 
186 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.38 
 
 
179 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.68 
 
 
182 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
186 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  28.92 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.68 
 
 
182 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
178 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  23.21 
 
 
182 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.67 
 
 
180 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.04 
 
 
180 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
178 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.71 
 
 
186 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
185 aa  58.5  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.25 
 
 
186 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.75 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.51 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  27.14 
 
 
177 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.74 
 
 
182 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  26.89 
 
 
183 aa  57  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
183 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  22.89 
 
 
182 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.64 
 
 
180 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
197 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
183 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  26.98 
 
 
173 aa  56.2  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.06 
 
 
193 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  28.36 
 
 
178 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.79 
 
 
185 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  31.78 
 
 
192 aa  55.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.86 
 
 
188 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.11 
 
 
186 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  32.12 
 
 
209 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.72 
 
 
180 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.11 
 
 
186 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.75 
 
 
188 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.03 
 
 
188 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.93 
 
 
182 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  33.04 
 
 
135 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.36 
 
 
180 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  33.94 
 
 
178 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.36 
 
 
180 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  32.43 
 
 
180 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  27.44 
 
 
187 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  25.15 
 
 
182 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  28.91 
 
 
178 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  40.58 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.4 
 
 
179 aa  52.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  41.79 
 
 
178 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.79 
 
 
178 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  30.32 
 
 
179 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>