More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0173 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.8 
 
 
181 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.39 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  32.18 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
180 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
178 aa  79  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0860  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.68 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  35.33 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.21 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  30.34 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.83 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.78 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
185 aa  72  0.000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.51 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.73 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  34.3 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.84 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.93 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
180 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  27.22 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.86 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.68 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.68 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.05 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.93 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  25.6 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.84 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  25.58 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  28.47 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  29.03 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  28.02 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  30.36 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0488  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.71 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.168229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0427  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.28 
 
 
175 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0288097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  31.03 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.79 
 
 
186 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.73 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  26 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  27.38 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  30.1 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.12 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  27.06 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.98 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  32.1 
 
 
274 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  32.74 
 
 
275 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.95 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  32.73 
 
 
178 aa  62.4  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
184 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  29.52 
 
 
178 aa  62  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  34.94 
 
 
158 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  27.01 
 
 
179 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  31.98 
 
 
178 aa  62  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
180 aa  62  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
182 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.69 
 
 
186 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
179 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  35.92 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  28.65 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0190  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  32.84 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.22 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  30.43 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.89 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4610  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.994341  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  32.46 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  40.3 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.22 
 
 
186 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.16 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  32.1 
 
 
274 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.86 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
179 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>