More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4331 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  80.9 
 
 
445 aa  697    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
445 aa  864    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.2 
 
 
443 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.2 
 
 
443 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.2 
 
 
443 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.73 
 
 
446 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  44.1 
 
 
448 aa  335  7.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  44.22 
 
 
449 aa  329  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  43.51 
 
 
275 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  43.12 
 
 
290 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.55 
 
 
271 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  39.47 
 
 
274 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  38.95 
 
 
275 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.5 
 
 
274 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  36.03 
 
 
269 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  37.13 
 
 
270 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  38.52 
 
 
274 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  36.13 
 
 
273 aa  147  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.94 
 
 
269 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  38.15 
 
 
274 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  36.25 
 
 
276 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  38.46 
 
 
271 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  35.27 
 
 
275 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  36.21 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 
274 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  35.84 
 
 
275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.38 
 
 
276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  36.16 
 
 
271 aa  126  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  37.55 
 
 
271 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.28 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  33.47 
 
 
271 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  32.59 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  30.45 
 
 
275 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  33.83 
 
 
270 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  31.2 
 
 
275 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.79 
 
 
278 aa  85.9  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.06 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  34.29 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  30.95 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.69 
 
 
186 aa  76.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  36.05 
 
 
181 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.26 
 
 
182 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  32.9 
 
 
184 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  34.46 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.54 
 
 
186 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.67 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  29.05 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.53 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  31.45 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  29.22 
 
 
179 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.75 
 
 
200 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  33.58 
 
 
178 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.62 
 
 
182 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  29.05 
 
 
181 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.51 
 
 
182 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.08 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.59 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  33.55 
 
 
181 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.82 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.46 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  67  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
156 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.07 
 
 
186 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 
156 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  28.3 
 
 
271 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  35.14 
 
 
182 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
186 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
179 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  32.47 
 
 
191 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  31.61 
 
 
194 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.56 
 
 
188 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.32 
 
 
179 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 
156 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.56 
 
 
178 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  29.56 
 
 
194 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.68 
 
 
186 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.09 
 
 
180 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.38 
 
 
179 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
182 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 
193 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.57 
 
 
193 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
183 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
186 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  43.66 
 
 
118 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  29.63 
 
 
191 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  25.41 
 
 
182 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30 
 
 
194 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  30.67 
 
 
192 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>