209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1214 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
191 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  50.6 
 
 
181 aa  167  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  48 
 
 
182 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  49.08 
 
 
182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  44.64 
 
 
195 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  51.81 
 
 
182 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  44 
 
 
181 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  42.94 
 
 
189 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  46.78 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  43.48 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  45.45 
 
 
175 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  48.78 
 
 
182 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  45.68 
 
 
179 aa  124  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  43.11 
 
 
188 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  48.75 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  44.1 
 
 
182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  42.07 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  42.77 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  42.53 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  41.42 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  39.55 
 
 
200 aa  114  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  41.25 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  42.6 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  41.95 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  36.11 
 
 
181 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  41.61 
 
 
184 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  41.21 
 
 
196 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  37.14 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  27.61 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  28.03 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  23.31 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.18 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  25.47 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  25.47 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  26.71 
 
 
448 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.77 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  32.43 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  35.62 
 
 
171 aa  61.6  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  29.32 
 
 
163 aa  61.6  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  32.43 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  32.08 
 
 
449 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  30.56 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  26.35 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.38 
 
 
173 aa  58.9  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.01 
 
 
445 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.63 
 
 
445 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  24.36 
 
 
164 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
446 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  27.15 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3970  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00376909  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  24 
 
 
443 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  24 
 
 
443 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  24 
 
 
443 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  27.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  32.35 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  55.1  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4190  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  55.1  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000644927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  27.21 
 
 
152 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  29.59 
 
 
172 aa  55.1  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.01 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.14 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>