260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1759 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
189 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  58.92 
 
 
184 aa  194  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  59.2 
 
 
182 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  55.49 
 
 
181 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  49.71 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  57.06 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  57.78 
 
 
184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  54.12 
 
 
200 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  53.3 
 
 
188 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  53.85 
 
 
194 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  51.15 
 
 
182 aa  154  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  50.62 
 
 
181 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  48.84 
 
 
193 aa  144  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  51.43 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  54.76 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  50.6 
 
 
192 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  47.83 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  48.12 
 
 
179 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  47.06 
 
 
194 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  40.24 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  47.7 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  49.38 
 
 
175 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  40.12 
 
 
180 aa  128  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  50 
 
 
179 aa  127  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  44.44 
 
 
193 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  43.03 
 
 
191 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  49.69 
 
 
191 aa  104  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  44.97 
 
 
179 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  42.29 
 
 
196 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  42.2 
 
 
181 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.54 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  34.84 
 
 
448 aa  81.3  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  32.5 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.34 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.46 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  35.48 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  32.85 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  33.08 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  33.08 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  39.69 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.45 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  28.4 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.65 
 
 
445 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  32.06 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  38.81 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  34.18 
 
 
449 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  29.01 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  34.01 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  35.33 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  34.11 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  38.17 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  33.78 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  30.49 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  35.14 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.55 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.01 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  34.01 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  35.14 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  34.01 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  34.01 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.01 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  29.85 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  41.04 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  34.46 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  34.85 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>