More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3419 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
178 aa  340  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  78.74 
 
 
179 aa  240  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  66.26 
 
 
168 aa  194  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  65.64 
 
 
168 aa  191  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  65.64 
 
 
168 aa  191  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  65.64 
 
 
168 aa  191  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  65.64 
 
 
168 aa  191  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  65.64 
 
 
168 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  65.64 
 
 
168 aa  191  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  65.03 
 
 
168 aa  191  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  65.64 
 
 
168 aa  191  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  65.03 
 
 
168 aa  191  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  65.03 
 
 
168 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  46.75 
 
 
173 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  46.75 
 
 
173 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  47.77 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  42.01 
 
 
171 aa  134  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  39.38 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  42.95 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  41.03 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  39.61 
 
 
168 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  35.95 
 
 
167 aa  111  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  41.83 
 
 
163 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  38.16 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  38.62 
 
 
167 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
165 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  36.18 
 
 
166 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  44.3 
 
 
162 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  38.26 
 
 
165 aa  100  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  34.64 
 
 
175 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.23 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
167 aa  99  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  33.14 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  37.74 
 
 
175 aa  97.4  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  32.68 
 
 
175 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.68 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  33.56 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  33.75 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  38.71 
 
 
166 aa  92.8  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  32.75 
 
 
175 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  33.33 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  34.87 
 
 
179 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  37.33 
 
 
203 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  31.17 
 
 
166 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  34.87 
 
 
179 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.1 
 
 
194 aa  88.2  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  35.62 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
179 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  33.56 
 
 
206 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  34 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  34 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  32.32 
 
 
203 aa  85.1  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  33.95 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  37.42 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.13 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  28.92 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  34.18 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
156 aa  79  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  32.41 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  32.43 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  32.43 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  32.47 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  31.85 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  37.41 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  31.51 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  33.1 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  34.81 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  31.54 
 
 
199 aa  72  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  34.27 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  30.52 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.32 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>