279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3191 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
156 aa  299  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  97.44 
 
 
156 aa  293  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  94.87 
 
 
156 aa  286  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  91.03 
 
 
156 aa  278  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  91.03 
 
 
156 aa  277  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  78.21 
 
 
156 aa  234  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  77.56 
 
 
156 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  230  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  230  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  230  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  230  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  230  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  230  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  230  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  76.92 
 
 
156 aa  230  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  76.28 
 
 
156 aa  228  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  75.64 
 
 
156 aa  227  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  75.64 
 
 
156 aa  226  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  72.44 
 
 
156 aa  224  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  71.79 
 
 
156 aa  213  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  67.95 
 
 
156 aa  207  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  68.59 
 
 
156 aa  207  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  66.03 
 
 
156 aa  201  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  64.1 
 
 
156 aa  190  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  62.18 
 
 
156 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  66.03 
 
 
156 aa  180  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0251  F0F1 ATP synthase subunit B  64.74 
 
 
156 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  63.46 
 
 
156 aa  176  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0299  F0F1 ATP synthase subunit B  63.46 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0304  F0F1 ATP synthase subunit B  63.46 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  62.18 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  57.05 
 
 
156 aa  166  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  52.56 
 
 
156 aa  157  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  51.92 
 
 
156 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  48.08 
 
 
156 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  48.72 
 
 
157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  49.36 
 
 
156 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  49.36 
 
 
156 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  49.36 
 
 
156 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  49.36 
 
 
156 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  48.72 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  47.44 
 
 
156 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  48.72 
 
 
156 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  48.08 
 
 
156 aa  141  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  50 
 
 
156 aa  140  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  48.08 
 
 
156 aa  140  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  46.79 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  46.15 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  47.44 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  46.15 
 
 
156 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  46.79 
 
 
156 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  44.23 
 
 
156 aa  137  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0211  F0F1 ATP synthase subunit B  59.38 
 
 
157 aa  136  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  45.51 
 
 
159 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  46.79 
 
 
156 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  45.51 
 
 
159 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  46.15 
 
 
156 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0306  F0F1 ATP synthase subunit B  50 
 
 
156 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000623248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  46.15 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  46.15 
 
 
156 aa  134  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  46.79 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  47.44 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  45.51 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  46.79 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3648  F0F1 ATP synthase subunit B  49.36 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000138088  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  46.79 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  46.15 
 
 
156 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  44.87 
 
 
156 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  47.44 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  46.36 
 
 
152 aa  130  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  45.51 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  45.51 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4134  F0F1 ATP synthase subunit B  48.72 
 
 
156 aa  130  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000412529  hitchhiker  0.00502547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  46.15 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3929  F0F1 ATP synthase subunit B  48.72 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00620185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4021  F0F1 ATP synthase subunit B  48.72 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165729  normal  0.907421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  43.59 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  46.58 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  44.87 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0189  F0F1 ATP synthase subunit B  49.36 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046503 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  42.31 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  41.67 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  43.59 
 
 
156 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  43.59 
 
 
156 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  42.95 
 
 
156 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  43.59 
 
 
156 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  43.59 
 
 
156 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  43.59 
 
 
156 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  48.08 
 
 
156 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  41.03 
 
 
156 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  42.95 
 
 
156 aa  124  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  45.51 
 
 
156 aa  123  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  41.67 
 
 
156 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  41.78 
 
 
146 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  42.31 
 
 
156 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>