287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  100 
 
 
182 aa  347  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  63.28 
 
 
195 aa  206  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  55 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  57.47 
 
 
175 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  57.65 
 
 
179 aa  175  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  59.01 
 
 
181 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  54.17 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  51.15 
 
 
189 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  55.49 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  57.65 
 
 
182 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  49.4 
 
 
194 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  54.34 
 
 
182 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  50.87 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  49.16 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  52.07 
 
 
193 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  45.93 
 
 
193 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  48 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  42.37 
 
 
200 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.38 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  47.95 
 
 
192 aa  131  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  41.51 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  43.45 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  48.55 
 
 
184 aa  128  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  44.19 
 
 
196 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  46.34 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  40.44 
 
 
194 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  35.03 
 
 
180 aa  105  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.06 
 
 
443 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.06 
 
 
443 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.06 
 
 
443 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  33.96 
 
 
206 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  37.18 
 
 
448 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  39.77 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  34.39 
 
 
199 aa  91.7  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.77 
 
 
445 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  32.91 
 
 
203 aa  88.2  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  43.6 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  36.71 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  45.57 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.84 
 
 
446 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  33.56 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  41.67 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  33.96 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  31.25 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  30.72 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  34.53 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  34.62 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  32.5 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  35.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  35.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  33.56 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  32.45 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  32.45 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  34.46 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  41 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  31.01 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  34.13 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  34.23 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  34.13 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  36.49 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  35.56 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>