256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1312 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  100 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  67.05 
 
 
175 aa  218  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  65.9 
 
 
179 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  59.54 
 
 
195 aa  201  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  55 
 
 
182 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  51.74 
 
 
181 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  49.72 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  47.83 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  47.06 
 
 
192 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  49.7 
 
 
184 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  46.41 
 
 
182 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  46.71 
 
 
182 aa  131  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  48.15 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  46.99 
 
 
188 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  49.4 
 
 
182 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  42.35 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  42.6 
 
 
200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  45.06 
 
 
194 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  47.88 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  43.33 
 
 
191 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  41.51 
 
 
193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  41.53 
 
 
196 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  38.89 
 
 
193 aa  111  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  45.18 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  38.41 
 
 
181 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  38.99 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  34.15 
 
 
172 aa  97.4  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  40.26 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  34.36 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.45 
 
 
206 aa  89  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.9 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  33.99 
 
 
448 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  33.13 
 
 
199 aa  84.7  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.77 
 
 
443 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  36.31 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.77 
 
 
443 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.77 
 
 
443 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.43 
 
 
445 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  32.1 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  38.1 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.44 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.19 
 
 
446 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  37.06 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 
445 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  37.74 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.06 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.95 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  30.97 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  30.28 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.92 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  28.24 
 
 
138 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  27.22 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  23.53 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  27.22 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  23.53 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.2 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28.97 
 
 
168 aa  61.6  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  26.04 
 
 
168 aa  62  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.62 
 
 
162 aa  61.6  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.59 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  32.72 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  32.72 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  32.72 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  32.72 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  31.97 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.63 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  27.98 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  28.68 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
175 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  30.61 
 
 
152 aa  57.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  32.1 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  25.48 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  32.24 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  24.39 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.83 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  33.83 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  36.3 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  33.83 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  26.76 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  31.48 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.77 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  33.83 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  33.83 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  33.83 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  33.83 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  33.83 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>