259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1778 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
193 aa  377  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  62.69 
 
 
194 aa  227  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  64.8 
 
 
193 aa  201  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  55.25 
 
 
200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  51.74 
 
 
179 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  55.17 
 
 
194 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  48.47 
 
 
172 aa  159  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  48.84 
 
 
189 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  43.35 
 
 
181 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  39.39 
 
 
180 aa  132  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  44.86 
 
 
188 aa  131  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  47.59 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  43.98 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  46.75 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  49.1 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  46.07 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  45.7 
 
 
181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  50 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  38.24 
 
 
195 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  43.45 
 
 
182 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  37.36 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  45.61 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  47.9 
 
 
184 aa  105  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  41.38 
 
 
179 aa  104  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  37.2 
 
 
193 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  41.01 
 
 
191 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  37.02 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  41.1 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  46.58 
 
 
191 aa  89.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  43.51 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  33.75 
 
 
164 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.74 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.44 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  31.48 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  34.15 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  31.38 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  31.84 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  31.13 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.34 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  34.92 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  28.05 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  28.4 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  28.18 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  29.81 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  32.64 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  33.57 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  33.57 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  35 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  35.04 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  35.04 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  35.04 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  31.08 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 
161 aa  62.8  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  27.74 
 
 
448 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
161 aa  62.4  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 
177 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  32.06 
 
 
146 aa  62  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  30.41 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  35 
 
 
171 aa  61.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  34.31 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  31.08 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  31.08 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  30.94 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  32.37 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.08 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  30.59 
 
 
449 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  28.8 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>