281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18240 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  100 
 
 
192 aa  373  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  54.27 
 
 
181 aa  170  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  48.26 
 
 
195 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  53.8 
 
 
188 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  50.6 
 
 
189 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  47.06 
 
 
181 aa  150  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  51.72 
 
 
182 aa  150  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  52.98 
 
 
184 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  54.07 
 
 
182 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  53.63 
 
 
182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  47.09 
 
 
200 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.07 
 
 
194 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  47.95 
 
 
182 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  44.94 
 
 
193 aa  135  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  46.33 
 
 
181 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  53.99 
 
 
184 aa  131  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.05 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  46.06 
 
 
175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  49.14 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  43.53 
 
 
179 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  41.1 
 
 
172 aa  128  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  44.57 
 
 
194 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  47.85 
 
 
181 aa  121  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  45.96 
 
 
193 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  48.17 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  41.95 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  41.92 
 
 
182 aa  104  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  40.32 
 
 
196 aa  97.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  33.54 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  43.03 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.68 
 
 
206 aa  88.2  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 
203 aa  84.3  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  34.64 
 
 
448 aa  83.6  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.46 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  35.06 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  31.76 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  32.5 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  35.67 
 
 
449 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  34.23 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  29.19 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  29.75 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  33.85 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.38 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.93 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.88 
 
 
443 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.88 
 
 
443 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.88 
 
 
443 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  29.14 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.2 
 
 
446 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.1 
 
 
445 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  31.79 
 
 
152 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  25 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.22 
 
 
445 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.39 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.65 
 
 
185 aa  61.6  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  61.6  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  31.48 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  32.02 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>