90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1977 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  59.12 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.22 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.19 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  51.53 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.21 
 
 		 187 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  47.64 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  47.64 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.67 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  48 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.14 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.37 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.37 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.04 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.13 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  47.4 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  52.51 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50.84 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.15 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.66 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  47.8 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.15 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  50.91 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.58 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.2 
 
 		 183 aa  128  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.94 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  45.7 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.31 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.26 
 
 		 161 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.28 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.55 
 
 		 180 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.55 
 
 		 180 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.58 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.36 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.78 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.89 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.48 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.16 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  35.44 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  28.12 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.99 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.39 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  32.94 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.86 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  31.67 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  31.67 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.54 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  25.33 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  26.36 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  26.77 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  30.34 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.37 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.71 
 
 		 166 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  32.56 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  27.49 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  31.76 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  31.96 
 
 		 166 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.25 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.52 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  33.08 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.07 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  26.83 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  33.85 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.33 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  22.6 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  23.94 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  36.84 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  36.62 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  36.73 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  30.16 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.59 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.17 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.94 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  30.47 
 
 		 184 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1318  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.15 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  26.56 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  40.28 
 
 		 156 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  40.28 
 
 		 156 aa  41.2  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  36.9 
 
 		 164 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  41.67 
 
 		 156 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>