108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2203 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 
189 aa  364  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.56 
 
 
207 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.05 
 
 
187 aa  131  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.44 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.1 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.1 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.28 
 
 
161 aa  122  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.74 
 
 
205 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.82 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.03 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.21 
 
 
187 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.44 
 
 
193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.59 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.03 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.12 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.44 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.33 
 
 
201 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.33 
 
 
201 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  49.02 
 
 
194 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.06 
 
 
185 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.98 
 
 
207 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.33 
 
 
200 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.04 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.5 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.33 
 
 
185 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.72 
 
 
183 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.16 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.46 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.46 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.76 
 
 
180 aa  91.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.95 
 
 
187 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  42.86 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  32.93 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.97 
 
 
215 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.28 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.46 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.43 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.85 
 
 
166 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.71 
 
 
199 aa  61.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  28.37 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.61 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  34.18 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.51 
 
 
163 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  26.51 
 
 
181 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  25.47 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
167 aa  48.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  27.5 
 
 
181 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  22.97 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  29.69 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  35.24 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  35.48 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  33.66 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  34.44 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  24.1 
 
 
174 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  29.32 
 
 
199 aa  45.4  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.77 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  32.26 
 
 
152 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  34.62 
 
 
168 aa  44.7  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
156 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.22 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 
156 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  22.6 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  28.03 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.8 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  30.36 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  30.3 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  38.46 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  30.3 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  30.3 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  30.36 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.32 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  24.83 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  34.29 
 
 
156 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  30.3 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  39.06 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1318  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.5 
 
 
164 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  30.16 
 
 
146 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  28.74 
 
 
195 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  23.78 
 
 
177 aa  42  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  31.5 
 
 
156 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0189  F0F1 ATP synthase subunit B  37.37 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046503 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  32.58 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  26.88 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.74 
 
 
270 aa  41.6  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>