84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4573 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 185 aa  361  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  94.59 
 
 		 185 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  88.65 
 
 		 185 aa  324  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  78.38 
 
 		 185 aa  285  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  80.54 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  81.62 
 
 		 185 aa  265  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  69.89 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.77 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.78 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.78 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.58 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  45 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.51 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.13 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.13 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.17 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.38 
 
 		 187 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.5 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  43.82 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.39 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.86 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.76 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.08 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.85 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.86 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  41.76 
 
 		 194 aa  97.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.03 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.25 
 
 		 161 aa  94.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.16 
 
 		 180 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.16 
 
 		 180 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.76 
 
 		 180 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.53 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.12 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.92 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.72 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.5 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.18 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  32.7 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.61 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.61 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  27.27 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  27.34 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.87 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  21.48 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.81 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.81 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  33.81 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  33.81 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.81 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.04 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.78 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  33.81 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  26.28 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  32.68 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.42 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  28.12 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  32.74 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  26.42 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.59 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.22 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  33.03 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.62 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  24.83 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  31.61 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  29.59 
 
 		 196 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  33.71 
 
 		 189 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 		 168 aa  42  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  29.47 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  34.62 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>