82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0931 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  100 
 
 		 194 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.11 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  65.87 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  67.07 
 
 		 207 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  52.45 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  50.99 
 
 		 208 aa  194  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  50.99 
 
 		 208 aa  194  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  57.07 
 
 		 193 aa  184  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.97 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.57 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.4 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.4 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.95 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.3 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.88 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.98 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.64 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.11 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.59 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.11 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.76 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.67 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.9 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  44.31 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  48.41 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.45 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.56 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.27 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.3 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.3 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.57 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.57 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.17 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.99 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.76 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.4 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.62 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.17 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  23.18 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  23.08 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.37 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  31.87 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  32.93 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.46 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.4 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.71 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  28.81 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  27.85 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.41 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  25.37 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  33.75 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  36.56 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.69 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.52 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  30.7 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.69 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.41 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  26.39 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  22.22 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  33.93 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 203 aa  42  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.09 
 
 		 173 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  32.61 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  24.41 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.9 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  29.85 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>