100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4814 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 188 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  80.54 
 
 		 185 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  80.54 
 
 		 185 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  77.3 
 
 		 185 aa  287  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  70.81 
 
 		 185 aa  262  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  74.05 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  68.98 
 
 		 186 aa  215  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.7 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.8 
 
 		 187 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.82 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.61 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.44 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.44 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.3 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.06 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.99 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.39 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  43.58 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  46.15 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.19 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.08 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.46 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.31 
 
 		 161 aa  106  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.26 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.56 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.56 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.56 
 
 		 180 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  41.45 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.78 
 
 		 161 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.5 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.97 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.74 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.9 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.95 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.18 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  32.47 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.27 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.72 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  34.78 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  32.18 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  22.52 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.29 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.06 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.25 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  30.47 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  32.64 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  34.51 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.5 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.03 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  35.04 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.21 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  26.52 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  32.37 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  32.21 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  30.49 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.57 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  34.65 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  27.7 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  28.12 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  30.94 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  35.37 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  39.02 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  32.56 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  26.42 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.84 
 
 		 140 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  32.1 
 
 		 166 aa  44.7  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  37.8 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0304  F0F1 ATP synthase subunit B  39.29 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0299  F0F1 ATP synthase subunit B  39.29 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.77 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  30.3 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.1 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  36.27 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  28.79 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  35 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  39.02 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  34.55 
 
 		 156 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  28.89 
 
 		 156 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.35 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 156 aa  41.2  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  26.76 
 
 		 238 aa  40.8  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>