123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2217 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
140 aa  272  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.65 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  47.1 
 
 
138 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.29 
 
 
140 aa  120  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.34 
 
 
138 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  35 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.71 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.14 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.57 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.43 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  28.57 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.43 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.77 
 
 
167 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.54 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.86 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.91 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  32.74 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  26.87 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  30.87 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  28.19 
 
 
156 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
156 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  28.99 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  26.09 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
194 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.57 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.86 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.32 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.86 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  26.76 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  25.9 
 
 
253 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.52 
 
 
174 aa  48.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  25.74 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  28.19 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.19 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.54 
 
 
143 aa  47.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1017  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.07 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000143879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.54 
 
 
143 aa  47.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  23.36 
 
 
164 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.26 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  27.07 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  25.56 
 
 
168 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.43 
 
 
179 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 
159 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 
159 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  28.19 
 
 
156 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  24.09 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.99 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  24.09 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  24.09 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  30.16 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  28.99 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  29.86 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.57 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.06 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  25.56 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  25.9 
 
 
194 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 
189 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  30.4 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  24.65 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  29.03 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  26.76 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.83 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  24.62 
 
 
175 aa  42  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  25.35 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  22.9 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  26.67 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.2 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>