116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0698 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
193 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  63.73 
 
 
208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  63.73 
 
 
208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.38 
 
 
205 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  58 
 
 
204 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  61.35 
 
 
207 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  60.12 
 
 
207 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  57.07 
 
 
194 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  48.41 
 
 
161 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.47 
 
 
187 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.43 
 
 
201 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.47 
 
 
187 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.43 
 
 
201 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.7 
 
 
187 aa  148  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.68 
 
 
207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.14 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.03 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  44.24 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.86 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.6 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  45.45 
 
 
185 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.16 
 
 
187 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.71 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  44.83 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.58 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  45.61 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  44.44 
 
 
189 aa  92  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.1 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.31 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.31 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.31 
 
 
181 aa  87  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.62 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.53 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.56 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.16 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.69 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.5 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.67 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  32.68 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.15 
 
 
203 aa  61.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  29.73 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.97 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.58 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  34.43 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.33 
 
 
179 aa  54.7  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
166 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  37.27 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.11 
 
 
161 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  36.75 
 
 
163 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
193 aa  51.6  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  29.71 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  25.66 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  32.29 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.04 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  29.73 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  34.07 
 
 
163 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.39 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.04 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
165 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  24.06 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.04 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.84 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.56 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  33.75 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  32.94 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.58 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  35.79 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.04 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.04 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  31.71 
 
 
168 aa  45.4  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.5 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
159 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
184 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  31.11 
 
 
159 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  39.81 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  39.81 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.59 
 
 
175 aa  45.1  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
159 aa  45.1  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.79 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.33 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  30.71 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  31.78 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  31.78 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  35.79 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3970  F0F1 ATP synthase subunit B  33.78 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00376909  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.19 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>