106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0911 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
163 aa  304  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  87.73 
 
 
163 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  85.89 
 
 
163 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  77.78 
 
 
164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  73.62 
 
 
163 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  77.64 
 
 
161 aa  185  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  77.64 
 
 
161 aa  181  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  56.05 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.2 
 
 
161 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.5 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  44.94 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.5 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.5 
 
 
162 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  45.57 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  43.04 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  44.94 
 
 
159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  55.41 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  41.14 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.34 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
159 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  43.59 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.97 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.98 
 
 
182 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.87 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.87 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  38.65 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  41.06 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  36.88 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  37.58 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.14 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.3 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  37.91 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.11 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  39.22 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  39.63 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  37.91 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.15 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  37.25 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  43.88 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  31.61 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.21 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.43 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.46 
 
 
205 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.61 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.71 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.28 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.21 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.95 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.59 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
238 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.59 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.21 
 
 
205 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  30.99 
 
 
163 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  27.61 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  27.61 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
195 aa  50.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.85 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.58 
 
 
194 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.05 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  31.03 
 
 
181 aa  47.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.62 
 
 
185 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  30.18 
 
 
163 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
179 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.32 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.71 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.85 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.6 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.59 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 
194 aa  44.7  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.09 
 
 
207 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  29.29 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.21 
 
 
179 aa  43.9  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  31.51 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  32.06 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.7 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  25.49 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  28.47 
 
 
448 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.74 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  30.99 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.11 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.74 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  27.15 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  27.22 
 
 
163 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  39.19 
 
 
277 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.04 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.66 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.25 
 
 
183 aa  41.2  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>