64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1319 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 
184 aa  342  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  60.12 
 
 
205 aa  141  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  56.71 
 
 
176 aa  137  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.42 
 
 
164 aa  97.8  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  40.94 
 
 
159 aa  94  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  43.1 
 
 
159 aa  91.3  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  40.27 
 
 
159 aa  90.9  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.11 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.4 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  40.54 
 
 
159 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  42.76 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  36.18 
 
 
161 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  36.43 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  42.07 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  42.07 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  39.83 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.45 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  37.82 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.83 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.82 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.62 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  39.31 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.57 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  38.71 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
161 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.6 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.7 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.61 
 
 
161 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.5 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 
163 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  37.33 
 
 
171 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.5 
 
 
162 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  40.45 
 
 
190 aa  54.3  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.38 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.46 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.26 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  36.17 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.05 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  31.43 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  30.23 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  29.65 
 
 
179 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.09 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.24 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.52 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.52 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.21 
 
 
194 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  28.65 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.26 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  29.09 
 
 
172 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.93 
 
 
175 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.82 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  26.22 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.29 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.88 
 
 
175 aa  44.7  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.78 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  25.62 
 
 
238 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.44 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  30.25 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  20.99 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  25.52 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  25.52 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.77 
 
 
203 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>