82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0711 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
162 aa  306  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  77.78 
 
 
162 aa  204  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  75.31 
 
 
162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  75.31 
 
 
162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  73.29 
 
 
161 aa  170  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  71.6 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  55 
 
 
164 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  53.85 
 
 
163 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  54.14 
 
 
163 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.56 
 
 
163 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.87 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.5 
 
 
163 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  51.88 
 
 
161 aa  114  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  42.77 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  42.14 
 
 
159 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  39.38 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50.62 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  41.14 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  39.62 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.01 
 
 
161 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  40.62 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.17 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  32.26 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  40.38 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  39.87 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  42 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  41.14 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  42.5 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  40.88 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  40.51 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.18 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  35.03 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.95 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.95 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  48.31 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.49 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  41.46 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.57 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.57 
 
 
180 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.03 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.33 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 
194 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.61 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.38 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  26 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.66 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.56 
 
 
207 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.62 
 
 
207 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  32.41 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  25.9 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.33 
 
 
173 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  23.53 
 
 
167 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.54 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  22.88 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  30.52 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  27.45 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.95 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.52 
 
 
189 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  25.64 
 
 
238 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  28.57 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  27.4 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.92 
 
 
207 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  28.06 
 
 
179 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.05 
 
 
193 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  24.68 
 
 
175 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.18 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.23 
 
 
187 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.92 
 
 
208 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  27.66 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  27.66 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.92 
 
 
208 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  39.47 
 
 
203 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  25.83 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.67 
 
 
205 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  25.33 
 
 
175 aa  40.8  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  26.39 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>