58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1622 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 180 aa  353  8.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  27.56 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  31.11 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  26.8 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.81 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  26.06 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  26.49 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.19 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  22.6 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  22.6 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.15 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  27.39 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  25.33 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  22.67 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1016  ATP synthase F0 subunit b  28.57 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000054828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.05 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  23.78 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.63 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0683  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.883671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  23.45 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  27.46 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  27.46 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  26.99 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.71 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.71 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.17 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  32.32 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  23.98 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  24.46 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  21.3 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.33 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  26.63 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  20.71 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  24.5 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.18 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  25.35 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  23.45 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  23.13 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  25.33 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  25.17 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0913  F0F1 ATP synthase subunit B  27.41 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000548594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  22.22 
 
 		 175 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  22.86 
 
 		 173 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  22.86 
 
 		 173 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  24.28 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  25.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  25.66 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.67 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>