88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4574 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 163 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  92.64 
 
 		 163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  87.73 
 
 		 163 aa  240  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  78.4 
 
 		 164 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  76.07 
 
 		 163 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  78.26 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  74.53 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  56.69 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.07 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  54.78 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  54.14 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  54.78 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  44.3 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  44.3 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  43.67 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  41.77 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  56.05 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  40.51 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.68 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  34.42 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  42.41 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.12 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.64 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.98 
 
 		 182 aa  90.9  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.12 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  38.04 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  39.74 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  40.52 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  38.75 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.51 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.92 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  39.22 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  36.6 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  37.25 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  37.91 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  38.12 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.83 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.03 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.87 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.7 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  29.71 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  28.4 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.02 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.02 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.02 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.28 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.3 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.76 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.71 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.14 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.42 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.95 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  26.88 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.5 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  41.89 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.74 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.74 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  37.11 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.32 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.1 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.32 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  25.93 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  29.75 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  25.93 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.55 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  29.85 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.95 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.41 
 
 		 207 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  34.15 
 
 		 164 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.92 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 		 194 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  33.33 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.72 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  34.94 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  34.21 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.85 
 
 		 194 aa  40.8  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  36.49 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.06 
 
 		 185 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>