79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3819 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 160 aa  303  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  57.23 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  54.67 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.92 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.36 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.97 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50.64 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  48.72 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  40.99 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.81 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  51.27 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.67 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  41.03 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  41.18 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  38.46 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  41.18 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.5 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.77 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.86 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.41 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  42.31 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  42.5 
 
 		 184 aa  84.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  32.48 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.96 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.41 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  42.48 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.34 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  48 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  40.67 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 		 184 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  40.82 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  35.59 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.95 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.08 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.82 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  37.25 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  29.13 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.07 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.61 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.09 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  24 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.64 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  34.44 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.2 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  32.03 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.74 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.51 
 
 		 208 aa  48.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.51 
 
 		 208 aa  48.1  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  29.03 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.83 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.4 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.83 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  25.5 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.63 
 
 		 264 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  28.46 
 
 		 185 aa  44.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  31.85 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  28.75 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.43 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.36 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  36.25 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  31.11 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 194 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  24.68 
 
 		 163 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.75 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  33.77 
 
 		 203 aa  42  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  31.72 
 
 		 165 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  25.31 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  25.66 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  32 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  35.17 
 
 		 196 aa  40.8  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.28 
 
 		 189 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.03 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>