97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0266 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 161 aa  308  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  77.64 
 
 		 164 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  88.82 
 
 		 161 aa  220  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  73.29 
 
 		 163 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  78.26 
 
 		 163 aa  213  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  78.88 
 
 		 163 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  77.64 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  54.49 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.34 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  46.75 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  45.45 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  46.75 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.55 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.93 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  38.31 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.69 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  41.56 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  41.67 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  54.14 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.1 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.37 
 
 		 182 aa  94.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.62 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.67 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  42.31 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.62 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  40.38 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  40.4 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  36.88 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.4 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  39.82 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  39.87 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  38.56 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  37.25 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.8 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  38.12 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.61 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.47 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  28.39 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  41.84 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.66 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.22 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.12 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.41 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.1 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  25.97 
 
 		 175 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.47 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.84 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  34.62 
 
 		 238 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.31 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 187 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  29.38 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  36.59 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.54 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.43 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  26.35 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  32.24 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.56 
 
 		 185 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.75 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.72 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.1 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  29.71 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  26.49 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  25.19 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  29.85 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  25.19 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.06 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  28.79 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.32 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.08 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  33.62 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.62 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.46 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.46 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  28.97 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  42.35 
 
 		 277 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  26.14 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.36 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.12 
 
 		 185 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 200 aa  40.8  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  32.76 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.46 
 
 		 192 aa  40.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.76 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.76 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>