105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0557 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
163 aa  315  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  96.32 
 
 
163 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  73.58 
 
 
161 aa  227  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  73.29 
 
 
161 aa  209  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  62.26 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  61.01 
 
 
159 aa  192  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  61.01 
 
 
159 aa  191  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  61.01 
 
 
159 aa  175  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  50.64 
 
 
159 aa  149  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.86 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.95 
 
 
161 aa  111  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  42.33 
 
 
163 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.51 
 
 
164 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  41.14 
 
 
184 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.23 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.59 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.23 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.37 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  51.89 
 
 
183 aa  91.3  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.75 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  36.77 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.94 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.87 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  39.24 
 
 
184 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  42.37 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  41.53 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  42.37 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  39.35 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.54 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.56 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  47.42 
 
 
190 aa  73.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.91 
 
 
182 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.37 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.26 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.9 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.14 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.91 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.12 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.19 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.13 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  29.14 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 
194 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.03 
 
 
173 aa  52  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
161 aa  52  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3057  F0F1 ATP synthase subunit B  29.56 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2914  F0F1 ATP synthase subunit B  29.56 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.71 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  35.48 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  26 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.1 
 
 
207 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.61 
 
 
166 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
159 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
159 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  27.03 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  35.04 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.88 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  26.35 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  26.35 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.26 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  34.25 
 
 
189 aa  44.3  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  24.83 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  22.44 
 
 
175 aa  44.3  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.03 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  29.03 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.03 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  27.22 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  22.44 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  24.2 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0304  F0F1 ATP synthase subunit B  30.32 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.83 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  30.26 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  24.03 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  25.48 
 
 
180 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.91 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  28.77 
 
 
156 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.91 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  25.31 
 
 
156 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  27.1 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.82 
 
 
187 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.18 
 
 
138 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.81 
 
 
206 aa  41.6  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  20.37 
 
 
175 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  26.85 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  37.63 
 
 
193 aa  41.2  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  28.1 
 
 
264 aa  41.2  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  25.17 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>